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身为博学派的领导人，珍宁对分歧者翠丝和老四展开了无情的追杀，翠丝的父母在追杀之中双双死去。 翠丝和老四一路逃亡，并且不断的试图获取其他派系同仁的支援和结盟，想要扩大实力，推翻珍宁的残暴统治。让两人没有想到的是，曾经最一无是处的无派系阵营如今成为了革命的中坚力量，而反抗军的首领，竟然是老四失散多年的母亲伊芙琳。然而，种种意外的发生令老四开始怀疑自己的母亲实际上另有打算，与此同时，翠丝亦发现了父母生前所隐藏的秘密。以这个秘密为诱饵，翠丝孤身一人来到了敌人大本营。。某日，东京一处房屋失火，房屋主人小林雅文（村木仁 饰）生不见人，死不见尸。小林是一名怪奇作家，他经常到传言闹鬼的地方体验采访，著书立作，同时还是一名电台灵异节目的主持人。他的失踪引起人们广泛猜测，而其留下的DV素材则称为寻找其下落的关键所在。 录像带中，小林曾拜访过一位中年妇女石井潤子（久我朋乃 饰），石井声称在隔壁经常能够听到婴儿的哭声，而那户人家根本没有小孩。在采访结束后不久，石井遭遇车祸身亡。小林坚信这起事故背后另有隐情，他由此展开更为深入的调查。然而调查越深入，离奇诡异的事件越来越多，而恐怖的真相也渐渐浮出水面……。《红色派系：起源》的故事将沿用游戏的背景和人设：自Alec Mason带领火星殖民地重获自由已经过去了25年，而他的妻子被杀，女儿Lyra被绑架也过去了12年，Alec自那时起便已是一名破碎的英雄。他剩下的唯一的儿子，Jake Mason，现在已经成为了红派民兵(Red Faction Militia)的军官，当他发现12年前被绑架的妹妹至今还活着时，他的世界被颠覆了。 　 即使有新的敌人蜂拥至火星，但Jake依旧决定去寻找他的妹妹，但他发现Lyra现在却成了敌对势力的一员，一个冷血的战士，发誓要毁掉红派(Red Faction)。Kate Vernon将饰演The Matriarch，入侵者的族长。。